第五章:基因组维持
5.1 DNA损伤
损伤类型
DNA损伤
分为两大类:
自发性损伤:
| 类型 | 机制 | 频率 |
|——|——|——|
| 脱嘌呤 | 糖苷键水解 | 10⁴/细胞/天 |
| 脱氨基 | 胞嘧啶→尿嘧啶 | 100/细胞/天 |
| 氧化损伤 | 活性氧(ROS) | 10³/细胞/天 |
诱发性损伤:
| 诱变剂 | 损伤类型 |
|——–|———|
| UV | 嘧啶二聚体(CPD、6-4光产物) |
| 电离辐射 | 双链断裂、碱基氧化 |
| 烷化剂 | 碱基烷基化 |
| 嵌入剂 | 碱基插入/缺失 |
常见DNA损伤
嘧啶二聚体:
- UV诱导,相邻嘧啶形成环丁烷环
- 阻碍DNA聚合酶前进
- 导致复制停滞
氧化损伤:
-
8-oxoG
(8-氧鸟嘌呤):G→T突变
-
胸腺嘧啶乙二醇
- 由活性氧(ROS)产生
5.2 DNA修复机制
直接修复
直接修复
:直接逆转损伤
| 类型 |
酶 |
机制 |
| 光修复 |
光裂合酶 |
光依赖,裂解嘧啶二聚体 |
| O⁶-甲基鸟嘌呤修复 |
MGMT |
转移甲基到自身 |
| 单链断裂修复 |
DNA连接酶 |
直接连接 |
切除修复
切除修复
:切除损伤片段,重新合成
碱基切除修复(BER):
损伤碱基 → 糖基化酶切除 → AP内切酶切割 → DNA聚合酶填补 → DNA连接酶连接
-
DNA糖基化酶
:识别并切除损伤碱基
-
AP位点
:无碱基位点
-
AP内切酶
:切割AP位点
核苷酸切除修复(NER):
损伤识别 → 解旋 → 切割(两侧) → 切除寡核苷酸 → 填补 → 连接
- 修复大的螺旋扭曲损伤(如嘧啶二聚体)
-
TFIIH
复合物:解旋
-
XPG
、XPF-ERCC1:切割
全基因组NER vs 转录偶联NER:
-
GG-NER
:全基因组扫描
-
TC-NER
:优先修复活跃转录基因
错配修复
错配修复
(MMR):
识别:
-
MutS
:识别错配
-
MutL
:介导
-
MutH
:切割(原核)
过程:
- 识别新合成链(甲基化标记或缺口)
- 切除包含错配的片段
- 重新合成
临床意义:
-
林奇综合征
(遗传性非息肉性结直肠癌)
- MMR基因突变导致微卫星不稳定
双链断裂修复
双链断裂修复
:最危险的DNA损伤
同源重组修复(HRR):
- 需要同源模板(姐妹染色单体)
- 高保真修复
- 主要发生在S/G2期
关键蛋白:
-
RAD51
:真核生物RecA同源物
-
BRCA1
/BRCA2:招募RAD51
非同源末端连接(NHEJ):
- 直接连接断裂末端
- 不需要同源模板
- 可能产生突变(末端处理)
- 主要发生在G1期
关键蛋白:
-
DNA-PKcs
:识别双链断裂
-
Ku70
/Ku80:结合DNA末端
-
DNA连接酶IV
:连接
5.3 同源重组
重组机制
同源重组
:同源序列间的DNA交换
Holliday模型:
- 双链断裂(或单链缺口)
-
链侵入
:单链侵入同源双链
-
D-loop
形成
-
Holliday连接体
形成
- 分支迁移
- 拆分(切开方式决定产物)
重组的生物学功能
| 功能 |
说明 |
| DNA修复 |
修复双链断裂 |
| 遗传多样性 |
减数分裂中交换 |
| 复制重启 |
复制叉崩溃后恢复 |
| 端粒维持 |
替代端粒延长(ALT) |
减数分裂重组
过程:
-
联会
:同源染色体配对
-
联会复合体
形成
-
Spo11
:诱导双链断裂
- 重组:形成交叉(Chiasma)
结果:
5.4 转座子
转座子类型
转座子
(Transposon):可移动的遗传元件
| 类型 |
机制 |
代表 |
| DNA转座子 |
“剪切-粘贴” |
P元件(果蝇) |
| 逆转录转座子 |
“复制-粘贴” |
LINE、SINE |
逆转录转座子:
-
LINE-1
(L1):长散在重复序列,占人类基因组17%
-
Alu
:短散在重复序列,占人类基因组11%
转座机制
DNA转座子:
- 转座酶识别末端反向重复(IR)
- 切除转座子
- 插入新位点
- 靶位点重复(TSD)
逆转录转座子:
- 转录为RNA
- 逆转录为cDNA
- 整合入基因组
转座子的影响
有害:
有益:
5.5 端粒与端粒酶
端粒结构
端粒
(Telomere):染色体末端的保护结构
- 序列:人类为TTAGGG重复(5-15 kb)
- 结构:T环(T-loop),3’端回折
- 功能:防止染色体末端被识别为DNA损伤
端粒酶
端粒酶
(Telomerase):
-
核糖核蛋白
复合物
-
RNA组分
(TERC):模板序列
-
蛋白质组分
(TERT):逆转录酶活性
机制:
端粒DNA 3'端 → 端粒酶结合 → 以RNA为模板延伸 → 移位 → 重复
端粒与衰老
端粒缩短:
- 正常体细胞:端粒酶活性低,端粒逐代缩短
-
Hayflick极限
:细胞分裂约50-60次后衰老
端粒酶与癌症:
- 85-90%的癌细胞端粒酶重新激活
- 维持端粒长度,获得无限增殖能力
- 端粒酶抑制剂是潜在的抗癌药物靶点
本章小结
- DNA损伤分为自发性和诱发性,类型多样
- 修复机制包括直接修复、切除修复、错配修复、双链断裂修复
- 同源重组是修复双链断裂的高保真方式
- 转座子是可移动遗传元件,对基因组进化有重要意义
- 端粒保护染色体末端,端粒酶维持端粒长度
思考题
- 为什么双链断裂是最危险的DNA损伤?细胞如何应对?
- 同源重组和非同源末端连接各有什么优缺点?
- 端粒酶在癌症治疗中有什么潜在应用?