第五章:原核生物基因表达调控
5.1 基因表达调控概述
调控层次
基因表达调控
发生在多个层次:
DNA → 转录 → RNA加工 → 翻译 → 蛋白质修饰
↑ ↑ ↑ ↑ ↑
染色质 转录 转录后 翻译 翻译后
原核生物特点:
- 转录和翻译偶联(无核膜分隔)
- 以操纵子为单位组织基因
- 主要调控点在转录水平
- 快速响应环境变化
调控类型
| 类型 |
机制 |
实例 |
| 负调控 |
阻遏蛋白抑制转录 |
乳糖操纵子 |
| 正调控 |
激活蛋白促进转录 |
CAP-cAMP |
| 双重调控 |
正负调控结合 |
乳糖操纵子 |
5.2 操纵子模型
操纵子结构
操纵子
(Operon)是原核生物基因调控的基本单位:
调节基因 - 启动子 - 操纵基因 - 结构基因群
↑ ↑
RNA聚合酶 阻遏蛋白
| 元件 |
功能 |
| 调节基因(Regulatory gene) |
编码调控蛋白(阻遏蛋白/激活蛋白) |
| 启动子(Promoter) |
RNA聚合酶结合位点 |
| 操纵基因(Operator) |
阻遏蛋白结合位点 |
| 结构基因(Structural genes) |
编码功能相关的蛋白质 |
调控蛋白
阻遏蛋白(Repressor):
- 结合操纵基因,阻止转录
- 可被诱导物失活(负调控)
- 可被辅阻遏物激活(阻遏型操纵子)
激活蛋白(Activator):
5.3 乳糖操纵子
负调控机制
乳糖操纵子
(Lac operon)是负调控的经典模型:
结构:
- 调节基因lacI:编码阻遏蛋白
- 启动子P_lac:RNA聚合酶结合
- 操纵基因O:阻遏蛋白结合
- 结构基因:lacZ(β-半乳糖苷酶)、lacY(通透酶)、lacA(转乙酰基酶)
调控过程:
| 条件 |
阻遏蛋白状态 |
操纵基因 |
转录 |
| 无乳糖 |
活性形式 |
结合 |
关闭 |
| 有乳糖 |
结合诱导物失活 |
不结合 |
开启 |
诱导物:
- 乳糖本身不是真正的诱导物
-
异乳糖
(allolactose)是真正的诱导物
- 实验室常用IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷)作为诱导物
正调控机制
CAP蛋白
(Catabolite Activator Protein)介导正调控:
葡萄糖效应(分解代谢物阻遏):
- 葡萄糖存在时:优先利用葡萄糖,乳糖操纵子低表达
- 葡萄糖缺乏时:cAMP水平升高,激活乳糖操纵子
机制:
葡萄糖缺乏 → cAMP升高 → cAMP-CAP复合物形成 → 结合启动子 → 转录激活
CAP结合位点:
- 位于启动子上游
- 结合后弯曲DNA,促进RNA聚合酶结合
综合调控
乳糖操纵子的双重调控:
| 葡萄糖 |
乳糖 |
cAMP-CAP |
阻遏蛋白 |
转录水平 |
| + |
- |
不结合 |
结合 |
关闭 |
| + |
+ |
不结合 |
不结合 |
低水平 |
| - |
- |
结合 |
结合 |
关闭 |
| - |
+ |
结合 |
不结合 |
高水平 |
只有当葡萄糖缺乏(cAMP高)且有乳糖(阻遏蛋白失活)时,乳糖操纵子才高水平表达。
5.4 色氨酸操纵子
阻遏型调控
色氨酸操纵子
(Trp operon)是阻遏型操纵子:
结构:
- 调节基因trpR:编码阻遏蛋白
- 启动子、操纵基因
- 结构基因:trpE、trpD、trpC、trpB、trpA(色氨酸合成酶各亚基)
调控过程:
| 条件 |
色氨酸作用 |
阻遏蛋白 |
转录 |
| 无色氨酸 |
无 |
无活性 |
开启 |
| 有色氨酸 |
辅阻遏物 |
有活性 |
关闭 |
衰减作用
衰减作用
(Attenuation)是色氨酸操纵子的精细调控机制:
前导序列(Leader sequence):
- 位于操纵基因和结构基因之间
- 包含4个可互补配对的区域(1、2、3、4)
- 编码14个氨基酸的前导肽(含2个Trp)
衰减机制:
情况1:色氨酸充足
- 前导肽顺利翻译
- 核糖体占据区域1,区域2自由
- 区域3-4配对形成终止子(发夹+poly-U)
- 转录提前终止
情况2:色氨酸缺乏
- 前导肽翻译停滞在Trp密码子(区域1)
- 核糖体停滞,区域2自由
- 区域2-3配对(抗终止子)
- 区域4无法配对,转录继续
衰减效率:
- 衰减作用可使转录降低约10倍
- 与阻遏作用协同,总调控可达700倍
5.5 其他调控机制
阿拉伯糖操纵子
阿拉伯糖操纵子
(Ara operon):
独特之处:
- 同一蛋白(AraC)既是阻遏蛋白又是激活蛋白
- 阿拉伯糖作为效应物改变AraC构象
调控模式:
- 无阿拉伯糖:AraC作为阻遏蛋白
- 有阿拉伯糖:AraC作为激活蛋白,结合CAP-cAMP
SOS应答
SOS应答
:DNA损伤应激反应
关键蛋白:
机制:
- DNA损伤 → RecA激活
- RecA促进LexA自切割
- LexA失活,SOS基因表达
- DNA修复后,LexA重新积累
SOS基因:
- 修复基因(uvrA、uvrB等)
- 易错聚合酶(Pol IV、Pol V)
- 细胞分裂抑制(sulA)
热休克应答
σ³²因子:
- 识别热休克基因启动子
- 温度升高时表达
- 保护蛋白质免受热损伤
5.6 翻译水平调控
核糖体蛋白合成
自体调控(Autogenous regulation):
- 核糖体蛋白结合自身mRNA的SD序列
- 抑制自身翻译
- 协调核糖体蛋白与rRNA的合成
反义RNA调控
机制:
- 反义RNA与mRNA互补配对
- 阻止核糖体结合或促进降解
- 调控质粒拷贝数等
本章小结
- 原核生物基因表达以操纵子为单位组织
- 乳糖操纵子是负调控和正调控的经典模型
- 色氨酸操纵子通过阻遏和衰减双重机制精细调控
- 同一调控蛋白可在不同条件下发挥不同作用
- 翻译水平调控是转录调控的补充
思考题
- 为什么乳糖操纵子需要双重调控(负调控+正调控)?
- 衰减作用的分子机制是什么?为什么只存在于原核生物?
- 比较乳糖操纵子和色氨酸操纵子的调控策略有何不同?